En algunas ocasiones la complejidad de las bases de datos evitan que la opción de despliegue de bases de datos desde el SSMS (SQL Server Management Studio) no sea posible, en estos casos existe un proyecto que nos permite realizar esas migraciones, excepto en casos donde las características de la base de datos no sean compatibles con SQL Azure en absoluto y no exista un equivalente, esta herramienta se llama SQL Database Migration Wizard y es muy sencilla de utilizar simplemente necesitas indicar la base de datos de origen y la base de datos destino y la herramienta se encarga de llevar a cabo la migración.
El proyecto esta en codeplex y tiene muy buen mantenimiento, en su última actualización agrego soporte a SQL Server 2014 (además de muchas otras características) aquí te dejo el link ¡Saludos!.